В здании международного терминала оснащены помещения для всех видов контроля: таможенного, пограничного, фитосанитарного, ветеринарного и санитарно-карантинного.
Терминал оборудован 110 кабинами паспортного контроля, из которых 6 адаптированы специально для маломобильных пассажиров. Особое внимание уделено внедрению высокотехнологичных интеллектуальных систем: пограничного и таможенного контроля, видеонаблюдения, управления доступом, а также самыми современными интроскопами и тепловизорами.
Ключевым элементом проекта стала система паспортного контроля "Сапсан", развернутая в 8 автоматизированных модулях. Она позволяет осуществлять паспортный контроль по биометрии, что значительно ускоряет и упрощает процедуру для пассажиров международных рейсов. Время прохождения контроля составляет всего от 30 до 60 секунд, а пропускная способность зоны увеличивается вдвое.
Ранее такая система была установлена в московских аэропортах Шереметьево и Внуково, и уже показала свою успешность, значительно сократив время прохождения границы. Все компоненты системы "Сапсан" преимущественно отечественного производства, а использование собственного программного обеспечения гарантирует безопасность и надежность эксплуатации.